Детская музыкальная школа №3 была открыта в 1959 году в Махачкале-I. Располагалась школа в трёх классах средней школы №12. Дети обучались по двум специальностям: фортепиано и баян-аккордеон. Возглавлял школу Аршад Абасалиевич Абасалиев. Коллектив школы насчитывал двух преподавателей и двадцать пять учащихся. Первый выпуск состоялся в 1965 году и составил 14 человек.

С 1968 года директором школы стал Шихабид Рамазанович Юсуфов. Благодаря его авторитету и поддержке Администрации города в 1985 году школа получила новое здание. С 1986 года директором  школы работала Валентина Фёдоровна Цурмилова, которая сумела создать в школе коллектив единомышленников. Она и по сей день работает  в школе заместителем директора по учебной работе.

С  2011 года директором школы назначен Андрей Валентинович Бондаренко. В настоящее время в школе обучаются около 650 учащихся. Обучение ведётся по следующим специализациям: фортепиано, скрипка, гитара, баян-аккордеон, ударные инструменты, духовые инструменты, классический вокал, эстрадное пение, фольклор, хореография, изо. Педагогический коллектив насчитывает  53  преподавателя и концертмейстера, 5 из которых имеют почётные звания «Заслуженный работник культуры РД», 4 –«Заслуженный учитель РД», 1 – «Заслуженный артист РД», 1 – «Заслуженный деятель искусств РД», 1 – «Заслуженный работник образования РД», 1 – «Почётный работник общего образования РФ». В школе функционируют образцовый детский фольклорный ансамбль «Лукоморье», муниципальный вокально-хореографический ансамбль «Горцы», хоры учащихся старших и младших классов, создан преподавательский ансамбль народных инструментов. За годы существования школы выпущены около 1000 учащихся, 160 из них продолжили музыкальное образование в средних и высших учебных заведениях культуры и искусства .Учащиеся школы активно участвуют в городских и республиканских конкурсах, фестивалях и концертах.  Лучшие из них отмечены именными стипендиями Главы Администрации г.Махачкалы С.Д.Амирова.